Bestimmung der Endophyten im Blutungssaft der Rebe mittels Next Generation Sequencing

Zusammenfassung Die Weinrebe stellt ein natürliches Reservoir ansässiger mikrobieller Ressourcen dar, die in komplexes Mikroökosystem eingebettet ist. Ziel dieser Studie war herauszufinden, welche Keime sich im Blutungssaft befinden. Gewinnung des Blutungssaftes erfolgte mittels einer sauberen, mit Alkohol desinfizierten PET-Flasche. Nach erfolgter Anreicherung wurde DNA-Extraktion anschließender NGS-Analyse der Zielregion V1V3 untersucht und erhaltenen Sequenzen NCBI-Datenbank abgeglichen. dominantesten Gattungen den Rebstöcken waren Pseudomonas Massilia , gefolgt von Zoogloea Bacillus Idonella Sphingomonas Paenibacillus . Zusätzlich konnte hefeähnliche Mikroorganismus Aureobasidium pullulans bei zwei bestimmt werden sowie wenige andere Bakteriengattungen, vereinzelt auftreten. literarisch beschriebene hemmende Interaktion zwischen auch unserer bestätigt werden. Alle bestimmten Mikroorganismen haben generell einen pflanzenstärkenden Einfluss stellen eine Basis für Besiedlung gewebespezifische Pflanzenteile dar.